Communication plante - plante médiée par l’activité microbienne
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- Début du projet : 01/01/2026
- Fin du projet : 30/06/2027
Le projet Plant2Mi2 vise à approfondir notre compréhension de la communication entre une plante hôte (Arabidopsis thaliana), une communauté microbienne synthétique (SynCom) et une plante parasite (Phelipanche ramosa).
En se basant sur une SynCom déjà caractérisée dans le projet ANR JCJC Plant2Mi, Plant2Mi2 visera à étudier les effets réciproques entre la SynCom, la plante hôte et la plante parasite.
Le projet s’articule autour de deux axes principaux :
(i) Étudier les effets d’une SynCom sur l’interaction plante-plante, en particulier son impact sur la physiologie de la plante hôte, la composition de son exsudome, et les conséquences indirectes sur la germination de la plante parasite.
(ii) Analyser l’effet des exsudats racinaires de la plante hôte sur la SynCom, afin de comprendre comment les composés exsudés modulent la structure et l’activité fonctionnelle de la SynCom et son rôle lors de la communication avec les graines de la plante parasite.
Pour cela, le dispositif de culture miniaturisé d’A. thaliana, ExuFlow, développé au laboratoire US2B, permet à la fois d’inoculer la SynCom et de collecter de manière non invasive les exsudats racinaires, ainsi que d’échantillonner la rhizosphère et les plantes dans des conditions contrôlées.
Ce système permet de suivre de manière dynamique la sécrétion des métabolites racinaires et leur évolution dans le temps, d’évaluer l’activité globale de la rhizosphère et de suivre la colonisation et le comportement de la SynCom.
Les analyses combinent métabolomique ciblée et bioguidée pour quantifier les précurseurs et stimulants de germination, métabarcoding pour suivre la composition et la stabilité microbienne, et (méta-)transcriptomique pour identifier les gènes différentiellement exprimés chez la plante hôte ou au sein de la SynCom. Ces approches complémentaires permettront de relier profils métabolomiques, composition microbienne et effets sur la communication plante–plante et la germination de P. ramosa.
