Ahmed CHOUKRI
Doctorant Université
octobre 2023 - septembre 2026
| Équipe : |
Thèmes de recherche
Sujet de Thèse : Interactions plante-plante médiée par l’activité rhizosphérique
Résumé : Ce projet de thèse vise à décrypter les mécanismes chimiques et moléculaires gouvernant la reconnaissance hôte-parasite entre Arabidopsis thaliana et la plante parasite obligatoire de racines Phelipanche ramosa, et à caractériser comment le microbiote rhizosphérique module activement ce dialogue chimique. Ces travaux ont mis en évidence une fonction inédite des strigolactones dans la répression de la biosynthèse des glucosinolates chez A. thaliana, avec des conséquences directes sur la stimulation de la germination du parasite. Par ailleurs, une approche multi-omique intégrative, combinant le métabarcoding, la métagénomique, la métatranscriptomique et la métabolomique, mise en œuvre via la plateforme de recyclage d’exsudats ExuFlow et le pipeline bioinformatique MAGNETO en collaboration avec le JGI, permettra de révéler comment les communautés microbiennes rhizosphériques modifient substantiellement le profil et l’activité biologique des produits de dégradation des glucosinolates, s’imposant ainsi comme des acteurs clés du dialogue chimique plante-parasite.
Encadrants : Lucie Poulin, Philippe Simier, Jean-Bernard Pouvreau
Financement : ANR Plant2Mi
Projets
Parcours universitaire
- 2023-2026 – Thèse, UMR CNRS US2B, équipe « Interactions plante-plante médiée par l’activité rhizosphérique », Nantes Université
- 2021-2023 – Master M@BioVa, Biologie végétale / Biotechnologies végétales, Université Cadi Ayyad, Marrakech, Maroc
- 2018-2021 – Licence Sciences de la Vie, mention Biotechnologies végétales, Université Ibn Zoher, Agadir, Maroc