Responsable : Leila TIRICHINE

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Les microalgues sont à la base de la chaîne alimentaire de l’écosystème marin. Elles jouent un rôle primordial dans l’équilibre de notre planète grâce à leur fonction de photosynthèse qui fait d’elle le premier producteur d’oxygène et un véritable puits de carbone. Au-delà de leur importance écologique, elles représentent une source importante de composés bioactifs utilisés dans les industries pharmaceutiques, agroalimentaires, cosmétiques et de l’énergie.

Malgré leur importance écologique et économique, les bases moléculaires impliquées dans la réponse des microalgues à leur environnement et l’impact des changements que connaît notre planète sur leur devenir et évolution sont très peu connus. Nous étudions les mécanismes moléculaires en particulier épigénétiques, notamment la méthylation de l’ADN et les modifications post-traductionnelles des histones impliquées dans la réponse des micro-algues aux facteurs biotiques et abiotiques de l’environnement. Nous utilisons des approches multi-échelles, de la cellule entière/génome aux gènes, combinées à de la bioinformatique intégrative pour comprendre la biologie des modèles/systèmes étudiés en tant qu’entité et dans un contexte plus globale. Nous nous intéressons plus particulièrement à un groupe dominant des micro-algues, les diatomées et utilisons des espèces modèles ainsi que des approches moléculaires pluridisciplinaires pour comprendre comment les diatomées répondent aux contraintes biotiques et abiotiques des océans actuels. Nous utilisons des espèces modèles et non modèles pour étudier les interactions des diatomées avec les bactéries en particulier de type diazotrophe.

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Projets

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Publications

6 publications

Maillard, Margaux; Stephant, Nicolas; Tanaka, Astsuko; Tirichine, Leila

Comprehensive protocol for preparing diatom cell samples and associated bacterial consortia for scanning electron microscopy Rapport technique

no. 103380, 2024.

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Manirakiza, Eric; Chaumier, Timothée; Tirichine, Leila

Complete genome sequence of a marine Pseudoalteromonas bacterial strain En ligne

Journals, ASM (Ed.): 2024.

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Denoeud, France; Godfroy, Olivier; Cruaud, Corinne; Heesch, Svenja; Nehr, Zofia; Tadrent, Nachida; Couloux, Arnaud; Brillet-Guéguen, Loraine; Delage, Ludovic; Mckeown, Dean; Motomura, Taizo; Sussfeld, Duncan; 0and Lisa Mazéas, Xiao Fan; Terrapon, Nicolas; Barrera-Redondo, Josué; Petroll, Romy; Reynes, Lauric; Choi, Seok-Wan; Jo, Jihoon; Uthanumallian, Kavitha; Bogaert, Kenny; Duc, Céline; Ratchinski, Pélagie; Lipinska, Agnieszka; Noel, Benjamin; Murphy, Eleanor A; 0and Ananya Khatei, Martin Lohr; Hamon-Giraud, Pauline; Vieira, Christophe; Avia, Komlan; 0and Shingo Akita, Svea Sanja Akerfors; Badis, Yacine; Barbeyron, Tristan; Belcour, Arnaud; Berrabah, Wahiba; Blanquart, Samuel; Bouguerba-Collin, Ahlem; Bringloe, Trevor; Cattolico, Rose Ann; Cormier, Alexandre; de Carvalho, Helena Cruz; Dallet, Romain; Clerck, Olivier De; Debit, Ahmed; Denis, Erwan; Destombe, Christophe; Dinatale, Erica; Dittami, Simon; Drula, Elodie; 0and Jeanne Got, Sylvain Faugeron; Graf, Louis; Groisillier, Agnès; Guillemin, Marie-Laure; Harms, Lars; Hatchett, William John; Henrissat, Bernard; Hoarau, Galice; Jollivet, Chloé; Jueterbock, Alexander; Kayal, Ehsan; Knoll, Andrew H; Kogame, Kazuhiro; Bars, Arthur Le; Leblanc, Catherine; Gall, Line Le; 0and Xi Liu, Ronja Ley; LoDuca, Steven T; 0and Philippe Lopez, Pascal Jean Lopez; Manirakiza, Eric; Massau, Karine; Mauger, Stéphane; Mest, Laetitia; Michel, Gurvan; Monteiro, Catia; Nagasato, Chikako; Nègre, Delphine; Pelletier, Eric; Phillips, Naomi; Potin, Philippe; Rensing, Stefan A; Rousselot, Ellyn; Rousvoal, Sylvie; Schroeder, Declan; Scornet, Delphine; Siegel, Anne; Tirichine, Leila; Tonon, Thierry; Valentin, Klaus; Verbruggen, Heroen; Weinberger, Florian; Wheeler, Glen; Kawai, Hiroshi; Peters, Akira F; Yoon, Hwan Su; 0and Naihao Ye, Cécile Hervé; Bapteste, Eric; Valero, Myriam; Markov, Gabriel V; Corre, Erwan; Coelho, Susana M; Wincker, Patrick; Aury, Jean-Marc; Cock, J Mark

Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems Article de journal

Dans: Cell, vol. 187, iss. 24, p. 6943-6965, 2024.

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Manirakiza, Eric; Chaumier, Timothée; Tirichine, Leïla

Genomic sequences and annotations of two Pseudomonas species isolated from marine and terrestrial habitats Article de journal

Dans: Microbiol Resour Announc ., p. e0037324, 2024.

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Zarif, Mhammad; Rousselot, Ellyn; Jesus, Bruno; Tirichine, Leïla; Duc, Céline

H3K27me3 and EZH Are Involved in the Control of the Heat-Stress-Elicited Morphological Changes in Diatoms Article de journal

Dans: Int. J. Mol. Sci., vol. 25, iss. 15, p. 8373, 2024.

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Timothée, Chaumier; Yang, Feng; Manirakiza, Eric; Ait-Mohamed, Ouardia; Wu, Yue; Chandola, Udita; Jesus, Bruno; Piganeau, Gwenael; Groisillier, Agnès; Tirichine, Leila

Genome-wide assessment of genetic diversity and transcript variations in 17 accessions of the model diatom Phaeodactylum tricornutum Article de journal

Dans: ISME Communications, vol. 4, iss. 1, p. ycad008, 2024.

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